Австралийские ученые раскрывают секрет кораллового генома

12.07.2011
Новости

   Австралийские ученые объявили о последовательности генома коралла Acropora Millepora, который является основным компонентом Большого Барьерного рифа и коралловых рифов по всему миру.

   Это первый проект генома животных будет осуществляться исключительно в Австралии, и является важной вехой в австралийской биотехнологии и в области изучения коралловых рифов, говорят исследователи из ARC - Центра передового опыта для коралловых рифов Исследования и Австралийский Фонд Исследования Генома (AGRF).

   "Это первое для австралийской науки. Здесь мы показываем, что Австралия может разблокировать генетический потенциал собственной уникальной флоры и фауны для национальной выгоды", говорит координатор проекта Кирби Симеринг из AGRF.

   Кораллы являются основой Большого Барьерного рифа, увлекая миллионы посетителей своим захватывающим разнообразием форм и ярких цветов. Однако, они также находятся под угрозой в связи с последствиями изменения климата, загрязнением окружающей среды, болезнями.

   "Этот проект имеет как практическое, так и научное значение. Это поможет нам понять, как кораллы строят рифы. И почему они не делают это, когда находятся в состоянии стресса", говорит профессор Дэвид Миллер из Центра передовых исследований коралловых рифов (CoECRS) и университета Джеймса Кука.

   "Кораллы имеют важное значение для Австралии. У нас лучше всего сохранившаяся система коралловых рифов в мире и Большой Барьерный Риф является краеугольным камнем, ведь туристическая индустрия приносит $ 6 млрд. в год. Так как рифовые системы по всему миру приходят в упадок, то это значение будет расти, если мы можем держать наши рифы здоровыми и нетронутыми ", объясняет доктор Элдон Бол из Австралийского Национального университета (ANU).

   Исследование показывает, что кораллы выглядят как простейшие организмы, но их ДНК является сложной. На самом деле, как сообщает Дэвид Миллер, кораллы имеют примерно одинаковое число генов, как у человека.

   Коралловый геном включая 28 хромосом и является одним из первых геномов животного мира. Чтобы быть упорядочены полностью с использованием технологии последовательности, одной из недавно возникших "следующего поколения секвенирования" метод, который производит огромное количество коротких последовательности, читает каждый около 100 символов.

   Ученые говорят, одна из главных задач в этом проекте было реконструировать сотни миллионов символов кораллового генома с помощью этих очень небольших последовательностей. Дополнительной проблемой является высокий уровень полиморфизма этого генома: как и большинство животных, коралл диплоидных (каждый состоит из двух почти идентичных набора генов - один от отца, и один от матери), но два гаплотипы (отец и мать половины генома) в большей степени отличается в кораллах, чем у других видов животных. Решение этих проблем требует, чтобы австралийские ученые разрабатывают ряд новаторских методов сборки генома.